Organ Yayasan Sosial Soegijapranata adalah sebagai berikut:
PEMBINA
Ketua : Mgr. Robertus Rubiyatmoko
Anggota : Sr. Anna Marie Tjung, PI
Anggota : Rm. Aloysius Gonzaga Luhur Prihadi, Pr
PENGAWAS
Ketua : Rm. YR. Edy Purwanto, Pr
Anggota : Rm. Albertus Nugroho Widiyono, SJ
Anggota : FX. Satrijanto
PENGURUS
Ketua : Rm. Yohanes Krismanto, Pr
Sekretaris Umum : Andri Prakasita Raharja
Sekretaris : Anastasia Posmaria Setiasiwi Sihotang
Bendahara Umum : Drs. Stephanus Maria Haris Sutyono
Bendahara : Florania Novy Hadikusomo
Anggota : Josef Agustinus Irwan Surja Permana
Anggota : Yoseph Edy Riyanto, SE
Anggota : Ir. Hadi Kumala
Anggota : Haryanto Santoso
Anggota : Priyo Suyono
Direktur Pelaksana : Br. Konradus Samsari, CSA
