Organ Yayasan Sosial Soegijapranata adalah sebagai berikut:

PEMBINA
Ketua                                                                 :   Mgr. Robertus Rubiyatmoko
Anggota                                                            :    Sr. Anna Marie Tjung, PI
Anggota                                                            :    Rm. Aloysius Gonzaga Luhur Prihadi, Pr

PENGAWAS
Ketua                                                                :   Rm. FX. Sukendar W, Pr
Anggota                                                           :    Rm. Romualdus Maryono, SJ
Anggota                                                           :    Yohanes Aji Prayitno

PENGURUS
Ketua                                                               :   Rm. Yohanes Krismanto, Pr
Sekretaris 1                                                   :    Drs. Fransiskus Satrijanto
Sekretaris 2                                                   :    Christianus Widya Utomo
Bendahara 1                                                  :    Drs. Stephanus Maria Haris Sutyono
Bendahara 2                                                  :    Florania Novy Hadikusomo
Anggota                                                          :    Josef Agustinus Irwan Surja Permana
Anggota                                                          :    Yoseph Edy Riyanto, SE
Anggota                                                          :    Andri Prakasita
Anggota                                                          :    Y. Wibowo Agung Sanyoto

Direktur Pelaksana                                :   Br. Konradus Samsari, CSA